분자가 탄생하는 모든 순간 포착
분자가 탄생하는 모든 순간 포착
  • 함예솔
  • 승인 2020.06.29 23:55
  • 조회수 652
  • 댓글 0
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기초과학연구원(IBS) 나노물질 및 화학반응 연구단 이효철 부연구단장(KAIST 화학과 교수) 연구팀은 원자가 결합해 분자가 탄생하는 모든 과정을 실시간으로 관찰하는 데 성공했습니다.

펨토초 엑스선 회절법 실험 과정의 모식도. 출처:IBS
펨토초 엑스선 회절법 실험 과정의 모식도. 출처:IBS

연구진은 펨토 초(1/1,000조 초)의 순간을 관측하기 위해 특수 광원인 포항 4세대 방사광가속기의 X-선자유전자레이저(펨토 초 엑스선 펄스)를 이용해 화학 결합을 형성하는 분자 내 원자들의 실시간 위치와 운동을 관측하는 데 성공했습니다. 이번 연구는 <Nature>에 게재됐습니다. 

펨토초 엑스선 회절법으로 관찰한 금 삼합체의 화학결합 메커니즘. 출처: IBS
펨토초 엑스선 회절법으로 관찰한 금 삼합체의 화학결합 메커니즘. 출처: IBS

 

  • 펨토 초 엑스선 펄스

펄스는 짧은 시간동안 만 빛이 방출되는 형태로 펨토 초 엑스선 펄스는 X선이 펄스의 형태로 생성되고 그 시간 길이가 펨토 초 정도일 때를 말합니다.

화학 반응의 시작부터 끝까지 원자 움직임 관찰했다

 

물질을 이루는 기본 단위인 원자들이 화학 결합을 통해 분자를 구성합니다. 하지만 원자는 수 펨토 초에 옹스트롬(1/1억 cm) 수준만 움직이기 때문에 그 움직임을 실시간으로 포착하기는 어려웠습니다. 

세계 최초로 화학반응의 시작부터 끝까지 전 과정의 원자의 움직임을 관찰하는데 성공했다. 출처: AdobeStock
세계 최초로 화학반응의 시작부터 끝까지 전 과정의 원자의 움직임을 관찰하는 데 성공했다. 출처: AdobeStock

연구진은 이전에 분자결합이 끊어지는 순간(Science, 2005)과 화학 결합을 통해 분자가 탄생하는 순간(Nature, 2015) 분자의 구조를 원자 수준에서 관측한 바 있으며 이번에 세계 최초로 화학 반응의 시작부터 끝까지 전 과정의 원자의 움직임을 관찰했습니다.

분자가 탄생하는 모든 순간 포착. 출처: IBS
분자가 탄생하는 모든 순간 포착. 출처: IBS

화학반응의 시작인 반응물과 끝인 생성물은 상대적으로 오랫동안 구조를 유지하지만, 반응과정의 전이상태(transition state)의 경우 매우 짧은 시간 동안만 형성되기 때문에 관찰이 더 까다로웠습니다. 

 

연구진은 기존보다 더 빠른 움직임을 볼 수 있도록 향상시킨 실험기법과 구조 변화 모델링 분석기법으로 금 삼합체(gold trimer) 분자의 형성과정을 관찰했습니다. 금 삼합체는 세 개의 금 원자로 이뤄진 화합물(화학식 : [Au(CN)2-]3)로, 수용액 상에서 가까운 곳에 흩어져 있다가 빛(레이저)을 가하면 반응하여 화학결합을 시작하는 특징이 있습니다. 

 

그 결과, 세 개의 금 원자를 선형으로 잇는 두 개의 화학결합이 동시에 형성되는 것이 아니라 한 결합이 35펨토 초 만에 먼저 빠르게 형성되고 360펨토 초 뒤 나머지 결합이 순차적으로 형성됨을 규명했습니다.

 

또한 화학 결합이 형성된 후 원자들이 같은 자리에 머물지 않고 원자들 간의 거리가 늘어났다가 줄어드는 진동 운동을 하고 있음도 관측했습니다. 연구진은 앞으로 단백질과 같은 거대분자에서 일어나는 반응뿐만 아니라 촉매분자의 반응 등 다양한 화학 반응의 진행 과정을 원자 수준에서 규명해 나갈 계획입니다.

이번 연구에서 관찰한 화학결합 과정과 진동운동. 출처: IBS
이번 연구에서 관찰한 화학결합 과정과 진동운동. 출처: IBS

제1저자인 김종구 선임연구원은 "장기적 관점에서 꾸준히 연구한 결과 반응 중인 분자의 진동과 반응 경로를 직접 추적하는 '펨토초 엑스선 회절법'을 완성할 수 있었다"며 "앞으로 다양한 유‧무기 촉매 반응과 체내에서 일어나는 생화학적 반응들의 메커니즘을 밝혀내게 되면, 효율이 좋은 촉매와 단백질 반응과 관련된 신약 개발 등을 위한 기초정보를 제공할 수 있을 것"이라고 포부를 밝혔습니다.


##참고자료##

 

  • Jong Goo Kim et al., "Mapping the emergence of molecular vibrations mediating bond formation", Nature 


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