DNA 내부 이상 구조 제어법
DNA 내부 이상 구조 제어법
  • 함예솔
  • 승인 2020.07.14 14:50
  • 조회수 2211
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DNA가 있다는 건, 그곳에 사람이 정말 살았다는 것. 출처 : 포토리아
DNA 내부 이상 구조 제어법 발견, 억제 활용될까? 출처 : 포토리아

세포가 DNA 내부의 이상 구조를 제어하는 방법이 밝혀졌습니다. 기초과학연구원(IBS) 유전체 항상성 연구단 이규영 연구위원팀은 암 억제 단백질 ATAD5가 DNA 내 이상 구조 형성과 해소를 조절하여 유전체 안정성을 유지하는 원리를 규명했습니다. 해당 연구는 <Nucleic Acids Research>에 게재됐습니다.

  • ATAD5(ATPase family AAA domain-containing protein 5) 단백질 

ATAD5 단백질은 4개의 단백질(RFC2,3,4,5)과 복합체를 형성해 PCNA를 조절하는 복제 조절 단백질입니다.

 R-루프 형성을 제어해  유전체 안정성 유지

R-루프 (R-loop) 구조. 출처: IBS
R-루프 (R-loop) 구조. 출처: IBS

우리 몸의 세포는 생명 유지를 위해 DNA 복제·전사·복구 등 다양한 대사 활동을 합니다. 이때 RNA가 DNA 이중나선의 한 가닥에 결합한 'R-루프(R-loop)'가 일시적으로 형성돼 대사 과정 일부를 도운 후 해소됩니다. R-루프가 해소되지 않고 장시간 유지되면 RNA 전사 단백질이 DNA 복제 단백질과 충돌하는 '전사-복제 충돌'이 일어납니다. 이 경우 DNA 복제와 전사가 완료되지 못한 채 멈춰버립니다. 이 상태에서 세포분열이 진행되면 DNA가 손상되어 유전정보 안정성이 떨어지고 암으로 이어질 수 있습니다.

DNA 복제 과정에서 ATAD5 단백질의 R-루프 조절 메커니즘. 출처: IBS
DNA 복제 과정에서 ATAD5 단백질의 R-루프 조절 메커니즘. 출처: IBS

유전체 항상성 연구단은 이전 연구에서 ATAD5 단백질이 DNA 복제 스트레스를 해소해 안정적인 DNA 복제를 돕고 암 억제에 기여한다는 것을 밝혔습니다. 이번 연구에서는 ATAD5 단백질이 DNA 복제 과정에서 R-루프 형성을 제어하여 전사-복제 충돌을 해결함으로써 유전체 안정성을 유지하는 방법을 규명했습니다.

  • R-루프(R-loop)

전사 과정에서 만들어진 RNA가 DNA 이중 나선의 한 가닥과 결합하고 나머지 한 가닥은 단일 나선 형태로 존재하는 DNA-RNA 혼성구조

  • DNA 복제 스트레스(DNA replication stress)

DNA 복제에 필요한 물질이 충분히 공급되지 않거나 세포가 유해물질에 노출되었을 때 DNA 복제가 멈추는 것을 말합니다. 복제 스트레스가 적절히 해소되지 못하면 유전정보 안정성이 떨어지고 암 발생으로 이어질 수 있습니다.

연구진은 우선 ATAD5 단백질이 R-루프 형성에 미치는 영향을 이해하기위해 siRNA를 이용해 인간 세포 내 ATAD5 단백질 양을 줄였습니다. 그 결과 DNA 복제가 진행 중인 세포에서만 R-루프의 양이 증가했습니다. ATAD5 단백질이 R-루프 형성 억제에 핵심 요소라는 의미입니다. 또한 염색체 복제를 도와주는 PCNA 단백질이 과다 축적돼 RNA 전사 단백질과 전사-복제 충돌을 일으키고 새로운 R-루프가 형성됐습니다. 이를 통해 ATAD5 단백질이 DNA 복제 부위에서 PCNA 단백질을 분리해 새로운 R-루프 형성을 미리 차단한다는 것을 알 수 있습니다.

 

추가적으로 연구진은 면역정제-질량분석법을 이용해 ATAD5 단백질이 R-루프를 풀어주는 DNA-RNA 풀림효소 단백질들과 상호작용함을 확인했습니다. ATAD5 단백질이 결핍되면 이 작용이 저해되어 DNA 복제 부위의 DNA-RNA 풀림효소 양이 줄어들었습니다. ATAD5 단백질이 DNA-RNA 풀림효소 양을 유지하여 복제 중인 DNA에 존재하는 R-루프를 제거한다는 의미입니다.

이번 연구에 참여한 IBS 유전체 항상성 연구단의 주요 연구진들. 출처: IBS
이번 연구에 참여한 IBS 유전체 항상성 연구단의 주요 연구진들. 출처: IBS

이규영 연구위원은 "이번 연구로 ATAD5 단백질이 DNA 복제 조절, DNA 복제 스트레스 해소뿐 아니라 DNA 내 이상 구조 제어 기능을 갖는다는 새로운 사실을 밝혔다"며 "R-루프는 암 발생과 밀접한 관련이 있는 DNA 복구, 노화와 관련된 텔로미어(Telomere) 길이 조절에도 중요하기 때문에 향후 암 치료제, 노화 억제제 개발에 기여할 것으로 기대된다"고 전했습니다. 

  • siRNA(small interfering RNA)

특정 유전자 서열에 특이적인 siRNA를 세포에 발현시키면 RNA 간섭(RNA interference) 기작을 통해 특정 유전자의 전령 RNA(messenger RNA) 양을 줄여 결과적으로 특정 단백질 양을 줄일 수 있습니다.

  • PCNA(Proliferating Cell Nuclear Antigen, 증식성세포핵항원) 

DNA에 결합하여 염색체 복제를 도와주는 단백질입니다. 염색체 복제 과정에서 여러 단백질을 끌어와 복제를 돕고 복제가 끝난 뒤 DNA와 분리됩니다.

  • 면역정제-질량분석법(Immunopurification-Mass spectrometry)

특정 단백질에 특이적으로 결합하는 항체(단백질)를 사용해 용액에서 해당 단백질 및 결합 단백질을 질량분석을 통해 확인하는 기술입니다.


##참고자료##

 

 


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